A análise e a pesquisa dos bens culturais constituem a base da prática museal. O programa de pesquisa do MCS/UEFS é desenvolvido com base na visão institucional de preservar, conservar, interpretar e vivificar a memória histórica e cultural de Feira de Santana e região. Para tanto, envolve atividades de planejamento e montagens expositivas, com seu acervo e de particulares; sistematização de acervos como de: Eurico Alves Boaventura, Monsenhor Renato de Andrade Galvão; sistematização documental digital dos acervos Jornal Folha do Norte.